玩家可以捕捉多只神兽,包括火焰鸟、急冻鸟、闪电鸟等经典神兽。火焰鸟位于火焰山的山顶,作为火属性神兽,其等级较高且战斗力强劲,建议携带水属性宝可梦进行克制。急冻鸟则隐藏在双子岛深处,需要利用冲浪技能到达岛屿,并按特定顺序推石头堵住瀑布后才能进入洞穴捕捉。闪电鸟出现在无人发电厂,属于电与飞行属性,地面或岩石属性宝可梦能有效免疫其电系攻击。这三只神兽等级均在50级左右,捕捉前需准备足够的高级球和状态异常技能。
除了三圣鸟外,游戏还隐藏着其他神兽。冰神柱位于双子岛的滑冰场区域,需要通过滑行撞击岩石触发出现。洛奇亚则栖息在第八座彩虹岛的右下方海域,等级高达70级,是后期队伍的重要战力。幽灵塔顶层的吉拉奇需要突破层层机关才能遇见,而7号岛海底则潜伏着红蓝水都,需使用潜水术探索。这些神兽的捕捉条件各异,部分需要完成特定剧情或解谜才能触发。
一周目通关后可捕捉的神兽包括雷公、炎帝和水君,它们会在关东地区的草丛中随机出现。雷公作为电系神兽具有高速特性,炎帝的火系技能威力惊人,水君则拥有优秀的防御能力。1号岛火焰山地下藏有古拉顿,需通过特殊通道进入;冠军之路2层则能遇到天空龙,这些神兽的等级普遍在50-60级之间。捕捉时建议使用刀背打击技能控制血量,并配合催眠或麻痹状态提高成功率。
部分神兽需要特殊道具才能唤醒或解锁。紫苑镇获得的宝可梦笛子可用于唤醒沉睡的卡比兽,而3号岛左边森林中的雪拉比则需要完成特定事件。创世神是唯一必须通过剧情任务获得的神兽,需在月见山击败火箭队并救出研究员后才能获取。神兽的技能组合往往包含强力的专属招式,如急冻鸟的暴风雪和闪电鸟的十万伏特,合理利用属性相克是战斗关键。
神兽的分布位置具有固定性,但出现条件各不相同。双子岛急冻鸟洞穴需要精确的推石头解谜,而岩山隧道深处的神兽则要求玩家掌握闪光技能。部分神兽如迪奥西斯出现在第九座彩虹岛的拼图房间,完成拼图后才会现身。建议在捕捉前保存进度,并携带具备状态技能的宝可梦如派拉斯特(孢子)或末入蛾(催眠粉),这些宝可梦能有效辅助捕捉过程。