口袋妖怪究极绿宝石进入二周目的关键步骤在于完成一周目主线剧情并触发特定条件。通关四大天王成为冠军后,游戏会自动存档并回到标题界面。重新读取存档时,主角会出现在自宅二楼,下楼与父亲对话可获得船票,这是开启二周目剧情的必备道具。母亲会询问关于神秘精灵颜色的选择,这决定了后续地图中随机遭遇的拉帝亚斯或拉帝欧斯种类。博士随后会将图鉴升级为全国版,解锁386种精灵的收集权限。
离开家后需前往凯那市或水静市码头使用船票乘船。在水静市港口会遇到亚希达,获得第二张船票用于前往对战开拓区。该区域包含七种不同规则的战斗设施,如对战塔、对战工厂等,挑战成功后能获得对战点数兑换稀有道具。部分神兽如三圣柱、裂空座等需在二周目特定地点触发事件才能捕捉。携带火钢兽的石头前往反转山脉可召唤席多蓝恩,而天空之柱顶层则需音速自行车技巧才能抵达并唤醒裂空座。
二周目新增的究极之洞剧情需要完成陨石碎片任务线。首先在武斗镇石之洞窟与希嘉娜对话获取碎片,随后在流星瀑布深处击败火岩队残党夺回mega手环。通过沙漠蜻蜓传送到天空之柱后,需成功攀爬至顶层与裂空座互动,获得其力量以解决陨石危机。该过程涉及多次与NPC的连续战斗,建议队伍等级达到75级以上并携带克制龙系的精灵。
隐藏要素方面,橙华森林可捕捉谢米,紫堇市游乐场需击败坂木获取暗影超梦,而海底遗迹则需通过三圣柱房间的步数谜题解锁雷吉奇卡斯。异乡人之屋的幽灵事件完成后可获得美梦神的羽毛,用于在水静市大桥召唤克雷色利亚。部分剧情如莉莉艾的究极异兽事件需在幕水镇上方究极之洞触发,涉及连续对战与空间跳跃。
对战设施挑战是二周目的核心玩法之一。对战金字塔要求玩家在黑暗环境中探索七层空间,对战宫殿则需依赖AI自动战斗机制。建议优先完成对战巨蛋的4V4双打比赛,因其允许预览对手阵容便于针对性布阵。所有设施通关四次后将遭遇特殊NPC,获胜可获得银/金象征及技能教学权限。队伍配置推荐以Mega进化精灵为核心,搭配高速控场与耐久型辅助。
最终阶段需在宇航中心乘坐飞船进入太空,使用裂空座对抗代欧奇希斯。该战斗结束后将解锁三周目剧情及彩虹火箭队基地。二周目整体流程约需15-20小时,重点在于全图鉴收集、对战设施征服及隐藏神兽捕捉。建议定期存档避免剧情中断,部分关键道具如音速自行车需通过紫堇市自行车店切换获得。